Ở trận đấu cuối cùng của mùa giải, Bayern Munich không còn quá quan trọng về kết quả, đội bóng của Flick không còn cơ hội cạnh tranh ngôi vô địch Bundesliga. Stuttgart vẫn còn hy vọng đạt vị trí á quân nhưng cũng không ảnh hưởng nhiều đến suất dự Champions League của Bayern Munich. Tuy nhiên, quá trình tuyển chọn HLV mới của Bayern đang gặp trở ngại, theo thông tin của nhà báo nổi tiếng Romano, Bayern và Flick đang thảo luận về khả năng ở lại, câu chuyện HLV Xavi tuyên bố rời bỏ rồi ở lại Barcelona có thể tái diễn tại Bundesliga.
Trong mùa giữa, Bayern công bố Flick sẽ rời khỏi sau mùa giải, nhưng sau khi Bayern lọt vào bán kết Champions League, ý kiến ủng hộ Flick ở lại từ bên trong câu lạc bộ và từ người hâm mộ đã lan truyền. Tuy nhiên, thái độ của Flick trong cuộc phỏng vấn không thay đổi, anh vẫn kiên quyết rời khỏi ông lớn Đức có giá 10 tỷ Euro. Nhưng với việc quá trình tuyển chọn HLV mới của Bayern bị trì hoãn, khả năng Flick ở lại một lần nữa trở thành vấn đề có thể thảo luận, vì Bayern hiện không có nhiều lựa chọn tốt trên thị trường chuyển nhượng.
Kể từ khi Flick quyết định rời câu lạc bộ, quá trình tuyển chọn HLV mới của Bayern không ngừng, bao gồm cả việc mời Alsono, Nagelsmann hay Rangnick nhưng họ đều từ chối lời mời của Bayern vì nhiều lý do khác nhau, giữ lại ở câu lạc bộ của mình. Trong số các lựa chọn khác, cả những HLV nổi tiếng châu Âu như Mourinho, Zidane hay Conte cũng không có khả năng cầm quân Bayern, thậm chí cả HLV của Crystal Palace hiện tại - Hodgson - cũng từ chối cơ hội dẫn dắt Bayern, điều này cũng làm tăng khả năng Flick ở lại.
Theo thông tin hiện tại, Flick đã đề xuất điều kiện ở lại cho Bayern, cần phải có sự ủng hộ tuyệt đối từ Hội đồng quản trị và phải có hợp đồng gia hạn mới. Hợp đồng giữa Flick và Bayern sẽ hết hạn vào năm sau và từ khi Flick đến, ban lãnh đạo Bayern đã có những thay đổi, cựu cầu thủ Kahn, người ủng hộ Flick, đã rời khỏi ban lãnh đạo của Bayern. Trong mùa giải này, Flick không nhận được sự ủng hộ tuyệt đối từ câu lạc bộ và gặp một số vấn đề trong việc quản lý phòng thay đồ, đây là lý do dẫn đến thành tích không tốt của Bayern.
Nếu Flick quyết định ở lại, đội hình hiện tại sẽ trải qua một số thay đổi, nhiều cầu thủ già của Bayern sẽ rời khỏi ông lớn Bundesliga, trong đó có Ribery đã xác nhận rời bỏ, cũng như đội trưởng Kimmich và Muller, đặc biệt là Kimmich trước đó đã có tin đồn xung đột với Flick và khả năng tiếp tục hợp tác giữa hai bên không lớn. Để loại bỏ những cầu thủ già của Bayern, cần phải có sự ủng hộ tuyệt đối từ ban lãnh đạo, đó cũng là lý do quan trọng mà Flick đưa ra điều kiện này, anh hy vọng tạo ra một đội hình phù hợp với yêu cầu chiến thuật của mình và có khả năng thực thi tốt hơn.